本系统由一个主模块—仓储管理系统模块和两个配套模块—计费及应收款管理系统模块和客户远程查询系统模块共同组成。
仓储管理系统模块主要管理仓储企业中各物资单位的货物流转情况；是以业务管理中心——单据和报表管理中心——统计报表来体现。
结算管理系统模块主要管理各物资单位的与货物流转相关的账务情况；从自动计费开始到合同费用的管理、应收应付款管理、催收账款查询管理和业务人员费用管理等。
客户远程Web查询系统模块通过互联网为客户提供业务信息的远程查询；包含:客户库存货物余额和各类对帐及分析报表的综合查询。
基本模块业务功能
业务管理中心——单据管理:1.货物到达时装卸管理——收货（装卸）单；2.货物验收入库管理——验收入库单；3.货物出库管理——发货单；4.库存管理中的货物过户管理——过户单；5.库存管理中的货物移库管理——移库单；6.货物发货出库后用户退还管理——退货单；7.大件货物拆零或拆包管理——开箱拆包单；8.货物在码头的中转管理——中转单；9.当货物发生损溢时的管理——调整单；10.货物的开平加工管理——加工单。
报表管理中心——统计报表:1.验收入库明细报表；2.发货明细报表；3.过户明细报表；4.货物变动汇总表和货物变动明细报表；5.各类物资吞吐库存报表；6.各单位货物流量排行表；7.结算中心操作员统计表；8.工作人员(理货员、叉车工、吊车司机、业务员等)工作量统计表；9.库存余额统计报表；10.提货费统计报表。
运输业务管理系统的功能包括两大部分:业务管理系统与报表系统。业务管理系统负责运输业务流程的计算机辅助实现；报表系统则负责运输业务数据的抽象再现，通过灵活的可定制的报表查询等形式，为运输经营者提供综合数据分析的能力。本系统也可以作为物流信息管理集成平台的一部分，以模块化的方式与其他业务子系统协同工作。运输业务管理系统将全面覆盖运输业务流程中的全部过程，并具有以下特点:
以单据为实施业务操作的方法，概念清晰，与实际业务近无缝连接
管理型软件，与现实业务环环相扣，有效的权限控、审核制度
提供方便、快捷、人性化的操作与查询界面，可为用户节约大量的人力培训成本。
强大而完善的报表系统
可以与智能系统集成平台实现无缝集成
运输业务管理系统主要包括以下功能模块:
运输系统设置系统设置包括员工设置、客户设置、货物设置、车辆设置等一些与运输业务密切相关的基础数据的设置。
承运单模块在运输业务洽谈结果的基础上产生承运单，它是实现运输业务流程计算机管理的基础。
调度单模块调度单模块贯穿了某一个运输业务流程的全部，它管理着运输过程中全部的数据信息。调度单支持着审核程序。
车辆修理管理车辆修理管理模块管理着车辆的维护状态，为运输业务的车辆调度提供重要的参考依据。
费用管理模块费用管理模块将运输业务涉及到的收支情况进行管理。
驾驶员工作量统计可以灵活地对任何时间段内驾驶员的工作完成情况进行统计，以及相关的支出统计等。
驾驶员个人利润核算可以详细反映出任何时间段内驾驶员出车状况、营业额、成本支出、利润完成情况等。
驾驶员过路费一览可以灵活地反映出任何时间段内驾驶员过路费的支出情况。
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