清理化粪池在很多人眼里是件很简单的工作，只是觉得化粪池太脏，没人愿意自己清理，事实上清理化粪池确实也不是什么多复杂的事情，只是它需要一些专业的工具和标准化的操作流程与清理知识，不然清理化粪池也是件不易的事情，而且有一定的危险性。
1.用铁钩打开化粪池的盖板，再用长竹杆(8m)搅散化粪池内杂物结块层。 2.把吸粪车开到工作现场，套好吸粪胶管(5m长，备3条)放入化粪池内。 3.启动吸粪车的开关，吸出粪便直至化粪池内的化粪结块物吸完为止，防止弄脏工作现场和过往行人的衣物。 4.盖好化粪池井盖，用清水冲洗工作现场和所有工具。 5.每年清理一次，一级池清运90％，二级池清运75％，三级池硬的表面全部清运。 6.清理后，目视井内无积物浮于上面，出入口畅通，保持污水不溢出地面。 7.在化粪池井盖打开后10～15min，人不站在池边，禁止在池边点火或吸烟，以防沼气着火烧伤人。(这个一定要注意!) 8.人勿下池工作，防止人员中毒或陷入水中。 9.化粪池井盖打开后工作员不能离开现场，清洁完毕后，随手盖好井盖，以防行人掉入井内发生意外。
因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用寄生虫的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。厌氧发酵:化粪池的密闭厌氧环境，可以分解蛋白性有机物，并产生氨等物质，这些物质具有杀灭寄生虫卵及病菌的作用。第二池:起进一步发酵、沉淀作用，与第一池相比，第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。第三池:主要起储存粪液的作用。