医院管理his系统主要模块有:
1)病人管理系统:病人新办诊疗卡、病人资料修改、病人换卡、病人退卡功能。
2)门诊医生工作站:病人接诊、医生工作站叫号、门诊病历录入、医生开电子处方、自动电子检验申请单、自动电子影像及医技申请单、自动检验报告返回和查询、自动影像和医技图像报告返回和查询、自动电子门诊手术申请单、自动电子门诊治疗单、协定处方调用、常用项目设置、门诊医生工作日志、病人历史病历查看、调阅复用历史处方、药品分级管理、处方审核功能、门诊传染病上传、门诊医生开住院电子申请单、药品不良反应登记、腹泻病人登记、发热病人登记。
3)门诊收费系统:门诊手工处方划价收费、系统电子处方收费、门诊处方全退费、门诊处方部分退费、门诊应急收费、收费员日结、收费处日结、门诊发票管理。
4)门急诊医保接口:医保病人收费明细上传、医保病人收费医保结算后接收、医保病人结帐，含湛江市医保系统接口。
5)住院出入院管理系统:此系统包含住院病人办理入院手续、预缴金管理、转床、转科、包床、指定主管医生等。
6)住院医生工作站系统:住院医生工作站包括医嘱处理（医嘱新开、提交、修改、删除、停嘱）、医嘱模板、父子医嘱、手术室医嘱处理、会诊医嘱处理。转科医嘱、手术医嘱、出院医嘱、死亡医嘱等的处理。
7)住院护士工作站系统:住院护士站包括医嘱核对转抄、医嘱执行、病区治疗单、病区退药管理、医嘱查询、病区补记账等。
9)住院收费医保接口:医保接口包括:入院登记病人基本资料同步医保系统；收费明细帐上传医保系统；医保系统结算结果返回后，HIS再结算。查询医保病人统筹、自付金额。通过查询科室医保费用情况，监控科室医保额是否超标。
10)住院中心药房系统:中心药房功能包括发放病区摆药单、发放病区退药单、发放门诊处方单、药房库存管理、药房进货管理、药房盘点管理、药房消耗统计等。
11)门急诊药房系统:门急诊药房配药、门急诊药房发药、门急诊药房退药、自动配药、自动发药、药房工作人员工作量统计、药房二级库存管理、药房向药库请领药品、门诊药房入库、门诊药房出库、科室领药、药房盘点、药房帐务结算。
12)药库管理系统:入库（包括初始化、内退）、出库（包括外退、报废）、盘点、调价、采购计划、账务期结转、药房请领审核、字典维护、库存查询管理、各种报表。