地源热泵系统要很好的运行必须要靠丰富稳定的地下水资源来供应。在采用地下水热泵系统之前，我们首先要做好详细的水文地质调查，并打勘测井，得到详细的地下温度、水的深度、水质与出水量等数据。最主要的就是要注意一下地下水位详细信息，如果地下水位较低，不仅成井的费用增加，水泵的运行能耗也随之增大。
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我们也曾介绍过热泵系统抽取的地下水循环过后还是会回到地下水层，但我国目前地下水回灌技术还不够精湛，在某些水文地质条件下回灌的速度大大低于抽水的速度，从地下抽出来的地下水经过换热器后不一定会全部被回灌回去，或多或少的还是会造成地下水资源流失。