由于化学防腐木里面含有对人体和牲畜有害的化学药剂，所以化学防腐木使用完毕后需要专门处理，从而增加使用成本。另外，化学防腐木地板不能回收利用，从而浪费木材资源。
毒效大:木材防腐剂的效力主要是由其对有害生物的毒性决定的，对危害木材的生物毒性越大，其防腐效果就越强。一般情况下，木材还要加入其他的剂，一是起防腐作用，而且可以增强木材的刚度，强度，耐用度。
持久性与稳定性好坏:木材防腐剂应具有较为稳定的化学性质，它在注入木材后，不易挥发，不易流失，持久地保持应有的毒性。
渗透力强弱:木材防腐剂必须容易渗透入木材内部，并且有一定的投入深度。
安全性高低:木材防腐剂对危害木材的各种菌虫要有较高毒性，但同时它应对人畜是低度或无毒的，对环境不会造成污染或破坏。随着人们对环境与可持续发展的关心，高效环保的复配木材防腐剂受到应有的重视，如上海欧默的ISU30,ISU40。
腐蚀性:防腐剂要对各种金属的腐蚀性小，偏于中性的比较理想。
对木材的危害性损害:木材经防腐处理后，对木材的力学强度、良好的纹理和悦人的色泽以不影响其使用度为宜。
价格低、货源广:为了促进木材防腐工业的发展，木材防腐剂必须有充足的货源，而且原材料价格低，具有竞争力。