全国保税区的分布情况:
1，凭祥综合保税区
2008年12月，国务院正式批准设立广西凭祥综合保税区。这是我国继苏州工业园综合保税区、天津滨海新区综合保税区、北京天竺综合保税区和海口综合保税区之后的第五个综合保税区。凭祥综合保税区是广西继钦州保税港区之后，再获国家批准设立的开放层次最高、优惠政策最多、功能最齐全、手续最便捷的特殊经济开放区域。凭祥综合保税区规划控制面积8.5平方公里。
凭祥综合保税区功能:凭祥综合保税区具有对外开放口岸、保税物流、保税出口加工、国际贸易、国际中转、国际配送，国内外采购、分销和配送等功能。
凭祥综合保税区除了享有保税区应有的优惠政 策外，还同时享有自治区《关于促进广西北部湾经济区开放开发的若干政策规定》中的优惠政策，是目前我国享受优惠条件最多的保税区之一。凭祥综合保税区实行封闭管理。海关总署将会同有关部门，切实做好凭祥综合保税区的监管、服务工作，促进其健康有序发展。
凭祥综合保税区作为中越跨境经济合作区的中方母体与越方对接。凭祥综合保税区除了拥有各大综合保税区的优惠政策外，还有民族自治区、西部大开发、边贸开发、大湄公河次区域合作等优惠政策，综合政策优惠居所有综保区之首。
2，郑州综合保税区
河南省人民政府2010年11月3日对外公布，郑州新郑综合保税区获得国务院批准，规划面积为5.073平方公里。这是中国中部地区迄今为止设立的第一个综合保税区。
3，北京天竺综合保税区
北京天竺综合保税区于2009年7月29日通过国务院联合验收组的验收，正式封关运作。北京天竺综合保税区于2008年7月由国务院批准成立，占地5.94平方公里，在顺义临空经济区内，将原有的空港保税物流园区和加工区整合在一起，以口岸通关、保税物流、出口加工等几个功能为主[1]。
北京天竺综合保税区整合了天竺出口加工区、空港保税物流中心（B型）、航空货运基地、空港物流基地的功能和政策，实现了政策叠加、优势互补。落户天竺综合保税区的企业可享受税收、海关、国检、外汇等政策优惠。区内企业之间进行货物交易，不征增值税和消费税。区内企业与区外企业交易，国内货物入区视同出口，可享受出口退税优惠。
北京天竺综合保税区是国务院批准设立的中国第10家综合保税（港）区，也是中国首家以空港为依托的综合保税区。北京天竺综合保税区封关验收后，不再保留北京天竺出口加工区和北京空港保税物流中心。
4，上海外高桥保税区
1990年6月，经中央批准，在上海创办了中国第一保税区——上海外高桥保税区。1992年以来，国务院又陆续批准设立了14个保税区和一个享有保税区优惠政策的经济开发区，即天津港、大连、张家港、深圳沙头角、深圳福田、福州、海口、厦门象屿、广州、青岛、宁波、汕头、深圳盐田港、珠海保税区以及海南洋浦经济开发区。目前全国15个保税区隔离设施已全部经海关总署验收合格，正式投入运营。
1992年，在邓小平同志南巡讲话发表之后，各保税区纷纷加快了实质性启动，基本建设进展迅速，初步形成了招商引资的软硬环境，海内外客商投资踊跃，大多数保税区首期开发区域的土地已批租或出让完毕，并在进一步开发二期工程，吸引外资工作也出现了可喜的局面。
经过多年的探索和实践，全国各个地区的保税区已经根据保税区的特殊功能和依据地方的实际情况，
逐步发展成为当地经济的重要组成部分，目前集中开发形成的功能有保税物流和出口加工。
随着中国加入WTO，全国保税区逐步形成区域性格局，南有以广州、深圳为主的珠江三角洲区域，中有以上海、宁波为主的长江三角洲区域，北有以天津、大连、青岛为主的渤海湾区域，三个区域的保税区成为中国与世界进行交流的重要口岸，并形成独特的物流运作模式。
5，苏州工业园综合保税区
苏州工业园区早在2005年就根据吴仪副总理对特殊区域进行“政策叠加、功能整合”的指示，积极探讨实现园区内的出口加工区、保税物流中心B型 和直通式陆路口岸、三区间的联动。2006年召开的第八次中新联合协调理事会进一步明确，允许苏州工业园区开展具有保税港区功能的海关特殊监管区域试点工作。2006年12月17日，国务院正式批准设立苏州工业园综合保税区。该区域执行保税港区的相关政策，是目前国内开放层次最高、优惠政策最多、功能最齐全的特殊功能区综合保税区整合了海关特殊监管区域的所有功能政策。如国外货物入区实行保税，国内货物入区视同出口、实行退税，企业在区内不仅可以进行货物的保税仓储和加工、制造业务，还将可以开展对外贸易（包括国际转口贸易），国际采购、分销和配送，国际中转，检测、维修，商品展示，研发，以及港口作业等业务。相比洋山、天津和大连等保税港区侧重的口岸通关功能，苏州工业园综合保税区直接服务于周边的加工制造业，为企业提供更为全面的功能平台，满足加工贸易的各种需求。
苏州工业园综合保税区是在园区现有的出口加工区、保税物流中心（B型）、直通式陆路口岸基础上进行功能整合和政策叠加而形成的，总面积5.28平方公里，本次验收4.2平方公里，集保税加工、保税物流、进出口贸易、采购分销、金融服务、检测维修、展示展览等功能于一体的特殊监管区域。将建立具有口岸作业、保税物流、保税加工、国际贸易等多种功能，配套服务完善的综合保税区，成为上海洋山港，浦东空港及太仓港在内陆地区的喂给、疏散港，最终发展成为长三角地区制造集群的生产服务业基地和重要的国际货物集散地。
6，重庆寸滩保税港区
重庆（寸滩）保税港区是我国首个内陆保税港区，也是首个同时拥有空港和水港的保税港区。该保税港区位于重庆市江北区寸滩港，规划控制面积8.37平方公里，分水港和空港两个功能区。其中，水港功能区面积6.00平方公里，四至范围为:东至江北区寸滩街道寸滩村甘蔗堡社、大桥社，南至沿长江至渝黔高速公路大佛寺大桥，西至渝北区人和镇童家院子立交，北至渝北区人和镇双碑村十七社、220国道。空港功能区面积2.37平方公里，分为两个地块。其中地块一面积1.04平方公里，四至范围为:东至渝北区双凤桥街道办事处硚田村七社，南至渝北区双凤桥街道办事处新华村十社，西至渝北区双凤桥街道办事处新华村十一社，北至渝北区双凤桥街道办事处硚田村九社；地块二面积1.33平方公里，四至范围为:东至渝北区古路镇荣华村八社，南至渝北区古路镇荣华村六社，西至渝北区双凤桥街道办事处黎家村十六社，北至渝北区古路镇荣华村七社。
7，重庆西永综合保税区
重庆西永综合保税区位于重庆市沙坪坝区西部新城的西永镇和陈家桥镇，重庆西永综合保税区是我国规划面积最大的综合保税区，于2010年2月26日正式挂牌成立。重庆西永综合保税区将成为重庆打造内陆开放高地的重要平台，目前该区已经吸引惠普、富士康、英伟达（nvdia）等一批IT巨头相继进驻,将助推重庆建成中西部第一大加工贸易基地。